Iñigo de Loiola naît à Azpeitia, en 1491. Le futur fondateur de la Compagnie de Jésus et considéré comme le Basque le plus universel, vit son enfance entre l'actuelle « Sainte Maison » ou Maison-Tour de Loiola et la ferme Egibar, résidence de sa nourrice María Garín. La ferme peut être visitée et elle abrite aujourd'hui le Musée de l'Environnement. La Sainte Maison se trouve à l'intérieur du sanctuaire, adossée à l'Église. Dans cette magnifique tour aux robustes murs des étages inférieurs et à l'élégante décoration mudéjar en briques de l'étage supérieur, on peut se faire une idée de la vie quotidienne des Oñaz-Loiola.
Iñigo était le plus jeune de 13 enfants et sa famille, qui possédait le patronage de la paroisse d'Azpeitia, était puissante et aux nombreuses relations. Le Contador Mayor de Castille (Trésorier Général de la Couronne) en personne demandera au Seigneur des Loiola de lui envoyer l'un de ses enfants pour l'accueillir dans sa maison comme l'un des siens. Iñigo eut le privilège d'être l'élu et il se rendit à Arévalo en 1505, où il séjourna jusqu'en 1517, durant toute sa jeunesse. Il sera ensuite homme de Cour et de Palais. Postérieurement, au service du Vice-Roi de Navarre, il participera à la prise de Najera SantaCasaLoiolaet il sera chargé d'une mission de paix au Gipuzkoa. En mai 1521, il est blessé en combat, à la citadelle de Pampelune, évènement qui est le point de départ de son processus de conversion. Durant sa longue période de convalescence à Loyola, qu'il consacre à l'étude et à la réflexion, Saint Ignace amorce sa maturation chrétienne.
À la suite de son pèlerinage en Terre Sainte, et après son passage par les Sanctuaires d'Arantzazu et de Montserrat, il fait des études à Barcelone, Alcalá et Paris, consacrant près de 12 années à sa formation universitaire. En avril 1535, il quitte Paris pour revenir d'incognito à Loyola, rendre visite à sa famille. Il demeure, non pas dans la luxueuse maison familiale, mais à l'Hôpital de La Madeleine d'Azpeitia. Durant ce bref séjour, il prêche à la chapelle de Notre-Dame de Elosiaga, perché sur un prunier et à l'Église Paroissiale de San Sebastián (Saint-Sébastien) de Soreasu à Azpeitia, où l'on conserve encore les fonts baptismaux dans lesquels il fut baptisé. Tout près du Sanctuaire de Loyola se trouve la chapelle d'Olatz du XIIIe siècle, qui abrite une magnifique image de la Vierge, à laquelle le Saint professait une profonde dévotion.
